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Die Suchmaschine für seltene Krankheiten, die Google übertrifft
In den späten 1940er Jahren prägte ein Professor an der University of Maryland School of Medicine einen ungewöhnlichen Ausdruck, um unerwartete Diagnosen zu beschreiben. Wenn Sie hinter sich Hufschläge hören, erwarten Sie nicht, ein Zebra zu sehen, sagte er. Der Ausdruck blieb hängen, und Mediziner verwenden heute häufig den Begriff Zebra, um eine seltene Krankheit zu beschreiben, die normalerweise als eine Krankheit definiert ist, die bei weniger als 1 von 2000 der Bevölkerung auftritt.
Seltene Krankheiten sind von Natur aus schwer zu diagnostizieren. Nach Angaben der European Organization for Rare Disease werden 25 Prozent der Diagnosen um 5 bis 30 Jahre verzögert.
Es ist daher keine Überraschung, dass Mediziner nach effektiveren Wegen suchen, um die Arbeit zu erledigen. Ein immer häufiger vorkommendes Hilfsmittel in diesem Prozess ist die Suchmaschine, typischerweise Google. Dies ist Teil eines iterativen Prozesses, bei dem ein Mediziner Symptome in eine Suchmaschine eingibt, Listen möglicher Krankheiten untersucht und dann nach weiteren Anzeichen für Symptome beim Patienten sucht.
Das Problem ist natürlich, dass gewöhnliche Suchmaschinen nicht für diesen Prozess optimiert sind. Google zum Beispiel hält Seiten für wichtig, wenn sie von anderen wichtigen Seiten verlinkt werden, die Grundlage seines berühmten PageRank-Algorithmus. Es ist jedoch unwahrscheinlich, dass seltene Krankheiten per Definition im Internet bekannt sind. Darüber hinaus werden Suchanfragen wahrscheinlich mit Rückgaben aus allen möglichen irrelevanten Quellen geplagt.
Heute stellen Radu Dragusin von der Technischen Universität Dänemark und ein paar Freunde eine Alternative vor. Diese Jungs haben eine maßgeschneiderte Suchmaschine für die Diagnose seltener Krankheiten namens . eingerichtet FindeZebra , ein Name, der auf dem gebräuchlichen medizinischen Slang für eine seltene Krankheit basiert. Nach dem Vergleich der Ergebnisse dieser Suchmaschine mit den gleichen Suchanfragen bei Google zeigen sie, dass relevante Ergebnisse deutlich besser zurückgegeben werden.
Die magische Soße in FindZebra ist der Index, mit dem es nach Ergebnissen sucht. Diese Jungs haben diesen Index erstellt, indem sie einen speziell ausgewählten Satz kuratierter Datenbanken zu seltenen Krankheiten durchsucht haben. Dazu gehören die Online mendelsche Vererbung im Menschen Datenbank, die Informationszentrum für genetische und seltene Krankheiten und Waisenkind .
Anschließend verwenden sie das Open-Source-Tool zum Abrufen von Informationen Indri um diesen Index über eine Website mit einer herkömmlichen Suchmaschinenschnittstelle zu durchsuchen. Das Ergebnis ist FindZebra.
Schließlich verglichen sie die Ergebnisse von Suchen auf FindZebra mit derselben Suche auf Google, die auf denselben begrenzten Datensatz angewendet wurde, eine Funktion, die mit erweiterten Google-Suchen möglich ist. Dragusin und Co. sagen, die Google-Ergebnisse seien deutlich schlechter als ihre eigenen.
Beispielsweise liefert auf FindZebra die Suchanfrage Junge, normale Geburt, Deformität beider Großzehen (fehlendes Gelenk), schnelle Entwicklung eines Knochentumors nahe der Wirbelsäule und Osteogenese bei Biopsie als erstes Ergebnis die korrekte Diagnose Fibrodysplasia ossificans progressiva. Diese Diagnose taucht jedoch in den Ergebnissen jeder Art von Google-Suche überhaupt nicht auf.
Dies deutet darauf hin, dass der PageRank-Algorithmus oder zumindest die Art und Weise, wie Google ihn optimiert hat, für diese Art der Suche nicht geeignet ist. Unsere Feststellung, dass FindZebra bei dieser Aufgabe Google insgesamt übertrifft und insbesondere, wenn es auf die Websites unserer Sammlung beschränkt ist (Google Restricted), legt nahe, dass der Google-Ranking-Algorithmus für die vorliegende Aufgabe suboptimal ist, schlussfolgern sie.
Obwohl immer noch ein Forschungsprojekt, haben Dragusin und Co. ihre Suchmaschine für seltene Krankheiten öffentlich zugänglich gemacht unter www.findzebra.com . Dies könnte eindeutig ein wertvolles Instrument für die medizinische Gemeinschaft werden.
Weniger klar ist jedoch, wie dieses Instrument von der Öffentlichkeit genutzt wird. Die Site kommt mit der verlorenen Nachricht: Warnung! FindZebra ist ein Forschungsprojekt und soll genutzt werden nur von Medizinern.
FindZebra könnte offensichtlich die Charta eines Hypochonders sein. Andererseits gilt das für jedes medizinische Wörterbuch.
Die informierte Öffentlichkeit besucht ihre Ärzte zunehmend mit detaillierten Informationen, die aus dem Internet heruntergeladen werden. Jeder Schritt zur Verbesserung der Qualität dieser Informationen muss sicherlich von erheblichem Wert sein.
Ref: arxiv.org/abs/1303.3229 : FindZebra: Eine Suchmaschine für seltene Krankheiten