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Britische Regierung wählt Illumina zur Sequenzierung von 100.000 Genomen
Die britische Regierung plant, das US-amerikanische Gensequenzierungsunternehmen Illumina mit der Sequenzierung von 100.000 menschlichen Genomen in dem größten nationalen Projekt zur Entschlüsselung der DNA einer Bevölkerung zu beauftragen.
Genmaschine: Ein Sequenzierinstrument von Illumina kann ein Genom an einem Tag entschlüsseln.
In eine behördliche Einreichung Mit der US-amerikanischen Securities and Exchange Commission sagte Illumina, es sei als bevorzugter Partner für das 100-Millionen-Pfund-Projekt ausgewählt worden.
Genomics England bestätigte, das kalifornische Unternehmen für die Durchführung des Sequenzierungsprojekts ausgewählt zu haben. Wir haben den „Bake-off“-Prozess durchlaufen, um das richtige Unternehmen für die Sequenzierung zu finden, und werden nun detaillierte Verhandlungen aufnehmen, sagt Vivienne Parry, eine Sprecherin von Genomics England.
Die Sequenzierungsinstrumente von Illumina dominieren den Markt für das Entwirren von DNA (siehe 50 Smartest Companies ). Parry sagt, dass sich weniger als fünf andere Unternehmen um den Job bewerben, eines der größten Sequenzierungsprojekte, die jemals durchgeführt wurden.
Einige andere Länder erwägen ebenfalls große nationale Sequenzierungsprojekte. Das britische Projekt wird sich auf Menschen mit Krebs sowie auf Erwachsene und Kinder mit seltenen Krankheiten konzentrieren. Da alle Briten Mitglieder des National Health Service sind, erwartet das Projekt, DNA-Daten mit detaillierten zentralisierten Gesundheitsdatensätzen vergleichen zu können (siehe Why the UK Wants a Genomic National Health Service ).
Während die Zahl der zu sequenzierenden Genome 100.000 beträgt, ist die Gesamtzahl der an der Studie teilnehmenden Briten mit etwa 70.000 geringer. Denn Genomics England beabsichtigt, für Krebspatienten die Sequenz sowohl ihrer ererbten DNA als auch der ihrer Krebserkrankungen zu erhalten.
Genomics England begann Anfang des Jahres mit potenziellen Bietern zu sprechen, darunter das chinesische Unternehmen und der Illumina-Rivale BGI (siehe Inside Chinas Genome Factory ). Zu dieser Zeit lagen die durchschnittlichen Kosten für die Vervollständigung eines Genoms bei etwa 3.000 bis 4.000 USD.
Die Vervollständigung aller 100.000 Genome hätte mehr als das Doppelte des Budgets von Genomics England gekostet. Die Agentur sagte im Dezember, sie wolle ihre Verhandlungsmacht nutzen, um die Preise zu drücken.
Illumina reagierte mit der Veröffentlichung eines neuen Systems, dem Hiseq X Ten, das angeblich in der Lage sein würde, Genome für jeweils 1.000 US-Dollar zu sequenzieren und damit eine lang erwartete Preisgrenze zu überschreiten (siehe Hat Illumina das erste 1.000-Dollar-Genom?).
Dieses System besteht eigentlich aus 10 Maschinen, die jeweils 1 Million US-Dollar kosten. Indem von den Käufern verlangt wurde, mindestens 10 Millionen US-Dollar in Ausrüstung zu investieren, stellte Illumina sicher, dass die niedrigeren Kosten seines neuen Systems die Preise in anderen Teilen des Sequenzierungsmarktes nicht stark beeinflussten, während es gleichzeitig große nationale Arbeitsplätze wie den in Großbritannien gewinnen konnte.
Laut Benutzern des neuen Illumina-Systems liegt der Preis pro Genom immer noch näher bei 2.000 US-Dollar als bei 1.000 US-Dollar.
Parry sagt, Illumina werde die Sequenzierung im Auftrag von Genomics England durchführen und die beiden würden die Verhandlungen in den nächsten zwei Wochen abschließen. Es ist ein enorm spannendes Projekt, das auf dem neuesten Stand der Technik ist. Das haben die Leute noch nie gemacht, sagt Parry. Wir werden an die Grenzen der Technologie stoßen.
[Update 12.07.14: Illumina wird im Auftrag von Genomics England 100.000 Genome sequenzieren. Eine frühere Version dieses Artikels sagte fälschlicherweise, dass Genomics England beabsichtigte, die DNA von 100.000 verschiedenen Individuen zu sequenzieren, und dies selbst mit Instrumenten tun würde, die von Illumina gekauft wurden.]